پدر امام خمینی، «سید مصطفی موسوی خمینی»، در سال ۱۳۲۳ قمری به قتل رسید. او در خمین، در مسیر بازگشت از دیدار با علمای تهران، مورد سوء قصد قرار گرفت و به شهادت رسید. قتل او توسط «جعفر قلی‌خان» و «میرزا قلی‌خان» و همدستانشان انجام شد و «جعفر قلی‌خان» در نهایت در تهران قصاص شد.

جزئیات ماجرای قتل:

• زمان:

  سال ۱۳۲۳ قمری (برابر با ۱۲۸۴ شمسی).

• مکان:

  در «خمین» و در مسیر بازگشت از دیداری با علمای تهران.

• مسببان:

  «جعفر قلی‌خان» و «میرزا قلی‌خان» به همراه همدستانشان.

• نحوه قتل:

  پس از تعارف نبات، تفنگ «میرزا قلی‌خان» را از دوش پدر امام خمینی برداشتند و از روبرو به او حمله کردند. سید مصطفی با اصابت گلوله به قلبش در دم جان باخت.

• پیامدها:

  خواهر، همسر و فرزندان سید مصطفی برای پیگیری مجازات قاتل به تهران رفتند و با پیگیری علمای تهران، «جعفر قلی‌خان» در میدان توپخانه قصاص شد.

یادآوری:

• امام خمینی در برخی نوشته‌های خود از نام «ابن‌الشهید» استفاده کرده است که به شهادت پدر ایشان اشاره دارد.
• برخی از اوراق و کتاب‌های باقی‌مانده از سید مصطفی پیش از انقلاب اسلامی به دست ساواک از بین رفت